Хвойное масло также готовится из хвойных веточек. Их так же, как и для сока, нужно как следует растолочь в ступе, постепенно добавляя кедровое масло, пока оно не станет появляться поверх истолчённой хвои. Далее перекладываем в чашу и оставляем на ночь. Наутро отжимаем, сначала вручную, заворачивая хвою в ткань, а потом так же, как кедровое масло, под прессом. Несмотря на похожее изготовление кедрового сока и хвойного масла, состав веществ в них абсолютно разный.
Хвойное масло кедра, сделанное на основе кедрового масла, применяется при желудочно-кишечных заболеваниях, ангине, авитаминозе, при заболевании полости рта и как средство от тошноты. Так же хорошо помогает, как мазь при кожных заболеваниях.